Sección de la columna de agua donde se encuentra el mayor gradiente de salinidad, es decir, la profundidad a la cual la salinidad varía más. Aguas más salinas pesan más y tienden a mantenerse por debajo de aguas menos salinas ("agua dulce" y/o salobres) y más livianas. Un rápido incremento de salinidad en aguas superficiales puede dar lugar temporalmente a haloclinas inversas.

Los cambios de salinidad que dan lugar a la haloclina son debidos principalmente en ganancias / pérdidas de agua, por ingreso de agua dulce desde desembocaduras de ríos, balance evaporación/precipitación, derretimiento/congelación hielo, ...